1) как в браузере получить массив байт или какой-то другой вариант, с описанием сертификата ЭЦП?

2)как отличить подписи между собой руководителя и сотрудника (тестовый пример что то все похожи между собой)?

Добрый день!

Вам отвечали эл. почте.

1) в формате base64 - как строка
Если Вас интересует конкретная реализация, то напишите на каком языке и какую библиотеку НУЦ РК Вы используете.
2) Извлекаете сертификат из подписи и смотрите расширение расширенное использование ключа. там должны быть соответствующие OID'ы:
1.2.398.3.3.4.1.1 Физическое лицо
1.2.398.3.3.4.1.2 Юридическое лицо
1.2.398.3.3.4.1.2.1 Первый руководитель юридического лица, имеющий право подписи
1.2.398.3.3.4.1.2.2 Лицо, наделенное правом подписи
1.2.398.3.3.4.1.2.3 Лицо, наделенное правом подписи финансовых документов
1.2.398.3.3.4.1.2.4 Сотрудник отдела кадров, наделенный правом подтверждать заявки на выпуск регистрационных свидетельств поданные от сотрудников юридического лица
1.2.398.3.3.4.1.2.5 Сотрудник организации
Полный список объектных идентификаторов Республики Казахстан (OID РК) можете посмотреть здесь.

JavaScript, NC Layer, функцию которая возвращается сертификат в формате base64, именно чтобы на стороне браузера получить сертификат, чтобы я мог его сохранить отдельно на сервере и проверять валидность.
в SDK
SDK 2.0\NCALayer\sample

Добрый день!

В NCALayer такой функции нет.
Вы можете написать свой модуль (bundle) для NCALayer с необходимым Вам функционалом.
Документация и пример реализации модуля для NCALayer содержится в SDK НУЦ РК в каталоге NCALayer\bundle_sample.