Здравствуйте. У меня есть веб приложение на node js, и мне нужно реализовать на нем электронную подпись. Есть ли примеры или может кто уже реализовывал это. Заранее Рахмет.

На node.js скорее всего вариантов нет. Лучше это делать через стороннее приложение (с применением SDK).

А есть ли варианты сделать это как то на клиенте не трогая сервер?

На клиенте (в браузере) это будет не секьюрно... потому что области хранения браузеров не сертифицированы по безопасности...
Обычно используют программную прослойку например NCALayer..

То есть мне надо отдельный сервис на пример на java запустить, и с ним общаться через api?

Вы можете разбить пример из пакета sdk на методы, и написать к ним node биндинги. Я рассматривал такой вариант для PHP, но пока не до этого, к тому же где-то промелькнуло, что в след. версиях sdk будет extension для php. Теоретически, писать экстеншны для node должно быть легче, хотя бы на уровне тулинга.