При запуске NCALayer создает свою папку, где хранит служебные файлы.

bundles:        папка для для установки\обновления модулей
ncalayer-cache: папка с установленными модулями
ncalayer.der:   файл с информацией о NCALayer и модулях (загружается из интернета при каждом запуске)
ncalayer.log:   файл журнала
settings.json:  настройки приложения

В каждой ОС они лежат в определенных местах. Папка создается в скрытых системных папках, поэтому переход к ней нужно осуществлять специфичным для ОС образом.

Windows

Откройте "Компьютер" или любую другую папку. В адресной строке укажите

%APPDATA%\NCALayer
# регистр не имеет значения

и нажмите клавишу "Enter".

Откройте домашний каталог NCALayer. Скопируйте файл в папку bundles. Запустите NCALayer. Откройте "Управление модулями", и убедитесь, что загруженный вами модуль был установлен.

Mac OS X

В меню приложения "Finder" выберите "Переход" -> "Переход к папке...". Либо "Переход к папке..." в контекстном меню "Finder".

В диалоговом окне укажите путь

~/Библиотеки/Application Support/NCALayer
или
~/Library/Application Support/NCALayer

и нажмите "Перейти".

Linux

Откройте файловый менеджер вашей среды рабочего стола. В адресной строке укажите

~/.config/NCALayer

и нажмите "Enter".